С началом Великой Отечественной войны окончила курсы медицинских сестёр, участница обороны Севастополя. За время боёв вынесла из-под огня и спасла жизнь десяткам бойцов и командиров Красной Армии. После попытки штурма Севастополя немецкими войсками в декабре 1941 года старший сержант М. К. Байда попросила перевести её в разведку. По воспоминаниям М. К. Байды, пойти в разведку её побудила не романтика, а ненависть к врагу: «Я видела столько крови и страданий, что просто у меня окаменело сердце. Не могла забыть разрушенные хаты, убитых детей, стариков и женщин…». 7 июня 1942 года немцы предприняли очередной штурм Севастополя. Рота разведчиков, в составе которой воевала Мария Байда, держала оборону в районе Мекензиевых гор. В ходе боя Мария получила ранение в голову и потеряла сознание. Пришла в себя ближе к вечеру. Как впоследствии оказалось, немцы прорвали оборону правее позиций разведчиков и зашли им в тыл. Из всей роты в живых остался один командир и полтора десятка бойцов — раненные они были взяты немцами в плен. Быстро оценив обстановку Мария приняла решение атаковать. Благодаря внезапности и правильной реакции пленных разведчиков, которые в свою очередь напали на немцев, как только Мария открыла огонь по врагу из автомата, все немцы были уничтожены. Прекрасно зная схему минных полей, под прикрытием темноты Мария Байда вывела раненых бойцов к своим. Согласно данным из ходатайства о награждении в ходе этого скоротечного боя Мария Байда уничтожила из автомата 15 немецких солдат и одного офицера, в рукопашной убив ещё четверых прикладом, сумела захватить пулемет и автоматы и спасла советского командира и 8 бойцов. 2 июля 1942 года тяжело раненой Мария Байда попала в плен. Попав в плен, держалась мужественно и стойко. Прошла концлагеря «Славут», «Равенсбрюк». Освобождена из гестапо американскими войсками 8 мая 1945 года. В 1946 году демобилизовалась и вернулась в Крым. С 1961 по 1986 год работала заведующей Центральным отделом ЗАГС Севастопольского горисполкома: за 25 лет работы она дала напутствия и вручила свидетельства о регистрации брака примерно 60 000 молодых пар, зарегистрировала более 70 000 новорожденных крымчан. Неоднократно избиралась депутатом городского совета. Умерла 30 августа 2002 года в Севастополе. Похоронена на Кладбище коммунаров.
